Konwertuj CDX na PNG

Struktury ChemDraw są eksportowane do PNG, gdy system obsługi manuskryptów, prezentacja, strona internetowa lub edytor obrazów wymaga standardowego obrazu zamiast edytowalnego dokumentu .cdx. PNG zapewnia również stały sposób renderowania diagramów chemicznych podczas udostępniania ich odbiorcom, którzy nie używają ChemDraw.

Co zawierają pliki CDX

CDX to niejednoznaczne rozszerzenie pliku. Najczęściej oznacza binarny, natywny format ChemDraw i ChemOffice, używany do przechowywania struktur chemicznych, reakcji, adnotacji, etykiet atomów, stereochemii oraz edytowalnego układu strony. Zachowaj ten plik źródłowy, ponieważ przechowuje obiekty chemiczne i informacje o rysunku, których PNG nie może zachować.

Osobny starszy format skompresowanych rysunków CorelDRAW również używał rozszerzenia .cdx. Pliki ChemDraw CDX i CorelDRAW CDX nie są wzajemnie zgodne, dlatego przed wybraniem oprogramowania lub usługi online ustal aplikację, w której plik został utworzony.

Dlaczego używa się PNG

PNG to bezstratny format rastrowy obsługiwany przez przeglądarki, oprogramowanie biurowe, systemy publikacyjne i edytory obrazów. Obsługuje przezroczystość i zachowuje cienkie linie wiązań, kliny, indeksy górne oraz tekst czytelniej niż JPEG, którego stratna kompresja może powodować widoczne artefakty wokół grafiki liniowej.

PNG zawiera piksele, a nie edytowalne struktury chemiczne. Nie zachowuje połączeń między atomami, przeszukiwalnych danych struktury, metadanych reakcji ani edytowalnych etykiet.

Eksportowanie plików ChemDraw CDX

1. Otwórz plik w ChemDraw, używając File → Open.
2. Sprawdź docelowy układ przed eksportem. Popraw przycięte etykiety atomów, nakładające się obiekty, granice strony oraz grubość linii wiązań przy docelowym rozmiarze wyświetlania.
3. Użyj File → Export i wybierz PNG. Dokładne nazwy menu oraz dostępne opcje eksportu różnią się w zależności od wersji ChemDraw.
4. Ustaw wymaganą liczbę pikseli. W przypadku druku o znanej szerokości fizycznej oblicz liczbę pikseli, mnożąc szerokość w calach przez wymaganą wartość ppi; 85 mm przy 300 ppi to około 1000 pikseli szerokości, a 170 mm — około 2000 pikseli.
5. Wybierz przezroczyste tło tylko wtedy, gdy aplikacja odbierająca je obsługuje i wymaga; użyj białego tła, aby uzyskać przewidywalny wygląd w edytorach tekstu i procesach drukowania.
6. Otwórz wyeksportowany plik PNG w rozmiarze 100% i sprawdź etykiety atomów, ładunki, kliny stereochemiczne, strzałki oraz mały tekst.

Użyj 300 ppi jako typowej wartości docelowej dla produkcji drukarskiej, jeśli wydawca jej wymaga, ale to wymiary w pikselach określają szczegółowość obrazu rastrowego; wartość ppi zapisana w pliku PNG wpływa głównie na jego domyślny rozmiar fizyczny w oprogramowaniu do składu. Nie powiększaj małego pliku PNG po eksporcie.

Inne opcje konwersji

W przypadku automatyzacji Open Babel może odczytywać wiele plików ChemDraw CDX i zapisywać wizualizację PNG, jeśli zainstalowana kompilacja obejmuje obsługę wyjścia PNG/Cairo:

obabel input.cdx -O output.png --gen2d

--gen2d generuje współrzędne dwuwymiarowe, gdy są potrzebne. Open Babel może nie odtworzyć dokładnie czcionek właściwych dla ChemDraw, układu strony, strzałek reakcji ani złożonych adnotacji, dlatego do grafiki publikacyjnej używaj ChemDraw i porównuj wynik z oryginałem.

CloudConvert i Zamzar oferują konwersję CDX do PNG w przeglądarce, ale upewnij się, że usługa rozpoznaje przesłany plik jako ChemDraw CDX, a nie jako format CorelDRAW. Przesyłaj wyłącznie pliki niepoufne; publiczne usługi konwersji nie nadają się do nieopublikowanych struktur, danych podlegających regulacjom ani materiałów klienta, chyba że ich warunki dotyczące prywatności i przechowywania danych spełniają wymagania obowiązującej polityki.

W przypadku starszego pliku CorelDRAW CDX otwórz go w zgodnej wersji CorelDRAW lub przy użyciu sprawdzonego starszego importera, a następnie użyj File → Export, aby wybrać PNG i ustawić wymiary w pikselach. Ogólne edytory obrazów zwykle nie otwierają bezpośrednio żadnego z wariantów CDX.

Ograniczenia zgodności i jakości

Pliku PNG nie można przywrócić do postaci chemicznie edytowalnego pliku CDX bez ponownego narysowania struktury lub użycia rozpoznawania struktur chemicznych. Narzędzia rozpoznawania mogą błędnie odczytywać etykiety atomów, ładunki, rzędy wiązań i stereochemię.

Zachowaj oryginalny plik .cdx i dodatkowo wyeksportuj plik wektorowy PDF, SVG lub EPS, jeśli wydawca albo proces drukowania obsługuje grafikę wektorową. Eksport wektorowy można skalować bez rasteryzowania linii wiązań i tekstu, natomiast PNG jest odpowiedni tam, gdzie wymagany jest stały obraz bitmapowy.