Konwertuj TXT na GCT

Czym jest format TXT

.txt to kontener zwykłego tekstu bez ustalonej struktury danych. Jest on często tworzony przez Notepad, TextEdit, edytory kodu, programy do obsługi arkuszy kalkulacyjnych, instrumenty laboratoryjne i bazy danych kodów do gier. Plik TXT może zawierać dane rozdzielane tabulatorami, wartości rozdzielane przecinkami lub czytelne dla człowieka kody do gier, dlatego zmiana jego nazwy na .gct nie stanowi prawidłowej konwersji.

Czym jest format GCT

GenePattern GCT to format macierzy rozdzielanej tabulatorami, używany do przechowywania danych dotyczących ekspresji genów i innych zbiorów danych genomowych. Zawiera znacznik wersji, liczbę wierszy i kolumn, nazwy próbek, identyfikatory cech, opisy oraz wartości liczbowe.

Nintendo Wii GCT to skompilowany binarny plik kodów do gier, używany przez loadery kodów, takie jak Gecko OS, USB Loader GX i CFG Loader. Zawiera zakodowane wiersze kodu, a nie zwykłe czytelne dane. Te dwa formaty nie są ze sobą powiązane i nie można ich wzajemnie wymieniać.

Jak przekonwertować TXT na GCT

W przypadku plików GenePattern GCT

1. Otwórz plik TXT w LibreOffice Calc, Microsoft Excel lub edytorze kodu i określ użyty separator. GenePattern GCT wymaga pól rozdzielanych tabulatorami, a nie polami rozdzielanymi przecinkami.
2. Uporządkuj dane tak, aby każda cecha znajdowała się w osobnym wierszu, a każda próbka w osobnej kolumnie. Użyj pierwszej kolumny na identyfikatory cech, a drugiej na opisy; nazwy próbek zaczynają się w trzeciej kolumnie.
3. Zapisz lub wyeksportuj tabelę jako tekst rozdzielany tabulatorami, zachowując kodowanie UTF-8 i wartości dziesiętne.
4. Dodaj nagłówek GCT. W przypadku macierzy zawierającej R wierszy danych i C kolumn próbek plik musi zaczynać się od:

#1.2
R	C
Name	Description	Sample1	Sample2

Drugi wiersz zawiera liczbę wierszy cech i kolumn próbek; nie uwzględnia pól Name i Description. Minimalny prawidłowy przykład:

#1.2
2	2
Name	Description	Control	Treated
GeneA		4.2	5.1
GeneB		7.0	6.6

Zapisz wynik z rozszerzeniem .gct, a następnie sprawdź go, wczytując w GenePattern lub innej aplikacji obsługującej GCT. Krótki skrypt Python do konwersji już rozdzielanego tabulatorami pliku może dodać nagłówek:

import csv

src = "input.txt"
dst = "output.gct"

with open(src, newline="", encoding="utf-8") as f:
    rows = list(csv.reader(f, delimiter="\t"))

header, data = rows[0], rows[1:]
with open(dst, "w", newline="", encoding="utf-8") as f:
    w = csv.writer(f, delimiter="\t", lineterminator="\n")
    w.writerow(["#1.2"])
    w.writerow([len(data), max(0, len(header) - 2)])
    w.writerows(rows)

W przypadku plików kodów do gier Nintendo Wii GCT

1. Pozyskaj kody do gier w obsługiwanym formacie źródłowym, takim jak plik tekstowy Gecko zawierający identyfikator gry i wiersze kodu szesnastkowego. Dowolny tekst opisowy lub niezwiązane dane TXT nie mogą zostać przekonwertowane.
2. Otwórz źródło w narzędziu przeznaczonym dla Wii, takim jak Wii Cheat Code Manager lub Ocarina Code Manager. Programy te analizują typy kodów, składają wymaganą reprezentację binarną i zapisują nagłówek GCT.
3. Wybierz grę, włącz żądane kody i użyj polecenia Export → GCT lub równoważnego polecenia zapisu. Nadaj plikowi nazwę gameid.gct, używając sześcioznakowego identyfikatora gry wymaganego przez loader.
4. Skopiuj plik do katalogu kodów oczekiwanego przez loader, zwykle /codes/ na karcie SD, a następnie włącz kody w loaderze. Dokładne zasady dotyczące katalogu i nazwy pliku zależą od loadera i regionu gry.

Nie używaj ogólnego internetowego konwertera TXT do kodów Wii. Zwykle zmieni on tylko nazwę pliku lub ponownie zakoduje plik bez kompilowania struktury binarnej, a przesyłanie plików kodów może ujawnić identyfikatory gier lub niestandardowy kod.

Jakość, zgodność i ograniczenia

Konwersja GenePattern zachowuje wartości tylko wtedy, gdy separator źródłowy, kodowanie, etykiety wierszy, etykiety kolumn i zapis dziesiętny zostaną poprawnie zinterpretowane. Sprawdź, czy nie występują puste wiersze, zduplikowane nazwy cech, tabulatory osadzone w tekście, przecinki jako separatory dziesiętne, brakujące wartości oraz formuły, które zostały przypadkowo zapisane jako wyświetlane wartości. Zachowaj kodowanie UTF-8 i unikaj zmian formatowania dat lub notacji naukowej w arkuszu kalkulacyjnym, gdy identyfikatory przypominają liczby.

GenePattern GCT w wersji #1.2 jest zwykle właściwym wyborem; niektóre aplikacje obsługują również wersję #1.3 z dodatkowymi metadanymi. Przed dodaniem metadanych lub zmianą nagłówka potwierdź specyfikację programu docelowego.

Zgodność Wii GCT zależy od regionu konsoli, wersji gry, typu kodu, loadera i wersji silnika kodów. Pomyślnie wygenerowany plik może nadal nie działać, jeśli kody dotyczą innego identyfikatora gry lub innej wersji. GCT nie jest skompresowanym formatem TXT, dlatego zmiana rozszerzenia lub kompresja źródła nie tworzy użytecznego pliku.